Metabolomics analysis
대사체학(Metabolomics)은 생체대사에 관여하는 작은 분자 기질, 중간물질, 생성물인 대사물질을 다루는 생화학적 대사 경로의 총체적 변동을 탐구하는 연구 분야입니다. 또한 대사체학은 외부 자극 또는 유전자 발현의 변화에 의해 세포에서 일어나는 생화학 대사경로에 대한 영향을 체계적으로 조사하는 것으로, 세포 내 대사물질의 프로필에 집중합니다. 대사적 프로파일링은 세포의 생리학적 상태와 변화를 대사체 관점에서 종합적으로 분석하여 생명체의 생리적 상태를 직접적으로 평가하는 정보로 기존 유전체나 단백체학 분석 정보에 독립적으로 제공될 수 있습니다.
적용분야
기술플랫폼
QTRAP 6500+
UPLC 1260
UHPLC 1290
Q-TOF 5600+
대표적인 발표 논문
One-stop Service
생물학적 샘플에서 후보 대사물질 검출까지의 통합 서비스
통계 및 생물정보학 분석 결과
Box plot of differential metabolites
Correlation analysis
Clustering analysis
Volcano plot
Quality control results
OPLS-DA
Correlation network analysis
Principal Component Analysis
서비스 소개
표적 대사체학 (Targeted metabolomics) |
Glycomics, Polyphenols, Organic acid, Quinones, Polyamine, Carotenoid, Amino acid |
비표적 대사체학 (Non-Targeted metabolomics) |
Precise metabolomics |
표적 대사체학 (Targeted Metabolomics)
표적 대사체학 (Targeted Metabolomics)은 생물학적 샘플에서 특정 대사경로의 대사체들을 분석하고 검출하는 방법을 말합니다. 비표적 대사체학 분석과 달리, 표적 대사체학은 향상된 특이성, 높은 감도, 그리고 정확한 정량화 등의 여러 가지 장점을 제공합니다.
장점
| 분석 | 응용 | 기전 | 인용논문(PMID) | 비고인용논문(DOI) |
Glycomics | 간 질환, 암, 당뇨병 | Glycosylation modification | 36866528 31974143 | |
Polyphenols | 심혈관 질환, 제2형 당뇨병, 암, 골다공증, 관절염 | 폴리페놀의 항산화 메커니즘 | 322101 | 10.3390/metabo10030119 |
Organic acid | 식물 연구: 식물 스트레스, 과일 품질 등 연구에 적용 질병 연구: 종양, 비만, 당뇨병 등의 질병 연구에 적용 | TCA 회로 및 면역 메커니즘 | 387199 36866528 3631172 30840893 | |
Quinones | 식물: 퀴논 대사 및 대사 경로 연구, 식물 색소 및 퀴논을 활용한 식물 품질 평가 | 항균, 항암, 지혈 및 기타 약물 연구에 유용 | ||
Polyamine | 질병 연구: 우울증, 불안 장애, 종양, 심혈관 질환 | 폴리아민 대사 경로 | 38775007 | |
Carotenoid | 연령 관련 황반변성 제2형 당뇨병 야맹증 호흡기 질환 | 카로티노이드 생합성 경로 | ||
Amino acid | 아미노산대사이상증(Aminoacidopathy) 당뇨병(Diabetes) 페닐케톤뇨증(Phenylketonuria) 요산혈증(Uric acidemia) | 아미노산 대사 경로 | 32321544 | 10.1186/s12989-020-00343-5 |
비표적 대사체학 (Non-Targeted Metabolomics)
LC-MS(액체 크로마토그래피-질량분석법)는 생물학적 샘플에서 분자량이 1000달톤 미만인 내인성 대사물질을 정량적으로 검출하는데 사용되는 중요한 분석 기술입니다. 이 기술은 샘플에 존재하는 대사물질을 종합적으로 프로파일링하고 식별할 수 있게 해줍니다. LC-MS데이터를 다변량 통계 분석과 대사 경로/네트워크 분석과 결합하면 변동하는 대사 경로와 변동 기전을 규명할 수 있습니다.
장점
| 인용논문 | PMID | PMCID | DOI |
Methionine-SAM metabolism-dependent ubiquinone synthesis is crucial for ROS accumulation in ferroptosis induction. Nature Communications. 2024 | 39420002 | ||
Metabolic Profiling of Cochlear Organoids Identifies α-Ketoglutarate and NAD+ as Limiting Factors for Hair Cell Reprogramming. Advanced Science. 2024 | PMC11425867 | ||
CSF multi-omics of intracerebral hemorrhage from onset to reperfusion underscores lipid metabolism in functional outcome. Science Bulletin. 2024 | 38971657 | 10.1016/j.scib.2024.06.005 | |
Intermittent dietary methionine deprivation facilitates tumoral ferroptosis and synergizes with checkpoint blockade. Nature Communications. 2023 | 37553341 | PMC10409767 | 10.1038/s41467-023-40518-0 |
Daytime-restricted feeding enhances running endurance without prior exercise in mice. Nature Metabolism. 2023 | 37365376 | 10.1038/s42255-023-00826-7 | |
PHGDH arginine methylation by PRMT1 promotes serine synthesis and represents a therapeutic vulnerability in hepatocellular carcinoma. Nature Communications. 2023 | 36823188 | PMC9950448 | 10.1038/s41467-023-36708-5 |
Precise Metabolomics Reveals a Diversity of Aging-Associated Metabolic Features. Small Methods. 2022 | 35527334 | 10.1002/smtd.202200130 |
Lipidomia
사업자번호 : 886-88-01793 / Tel : 031 751 3354 / Fax : 050 4394 0179
주소 : 13120 경기도 성남시 수정구 성남대로 1342, 가천대학교 반도체대학 창업보육센터 B113호
주문문의 : order@lipidomia.com / 학술문의 : lipidomia@lipidomia.com / 회계팀 : finance@lipidomia.com
Hosting by I'MWEB I Design by ADE
Precise Metabolomics Reveals a Diversity of Aging-Associated Metabolic Features. Small Methods. 2022
He Tian 1, Zhen Ni 1 2, Sin Man Lam 1 3, Wenxi Jiang 4, Fengjuan Li 4, Jie Du 4, Yuan Wang 4, Guanghou Shui 1 2
PMID: 35527334
DOI: 10.1002/smtd.202200130
Identification and Validation of Plasma Metabolomic Signatures in Precancerous Gastric Lesions That Progress to Cancer. JAMA Network Open. 2021
PMID: 34156450
PMCID: PMC8220475
DOI: 10.1001/jamanetworkopen.2021.14186
Omics-Driven Systems Interrogation of Metabolic Dysregulation in COVID-19 Pathogenesis. Cell Metabolism. 2020
PMID: 32610096
PMCID: PMC7311890
DOI: 10.1016/j.cmet.2020.06.016
Precise Metabolomics Defines Systemic Metabolic Dysregulation Distinct to Acute Myocardial Infarction Associated With Diabetes. Arteriosclerosis,Thrombosis and Vascular Biololgy. 2023
PMID: 36727520
DOI: 10.1161/ATVBAHA.122.318871
CSF multi-omics of intracerebral hemorrhage from onset to reperfusion underscores lipid metabolism in functional outcome. Science Bulletin. 2024. Yibin Jiang, Sin Man Lam, Shuixian Zhang, Huan Miao, ...,Guanghou Shui, Rong Hu
PMID: 38971657
DOI: 10.1016/j.scib.2024.06.005
Daytime- restricted feeding enhances running endurance without prior exercise in mice. Nature Metabolism. 2023. Haoran Xin, Rongfeng Huang, Meiyu Zhou, Guanghou Shui, Zhihui Zhang*, Catherine C L Wong*, Min-Dian Li*.
PMID: 37365376
DOI: 10.1038/s42255-023-00826-7
Endogenous ceramide phosphoethanolamine modulates circadian rhythm via neural–glial coupling in Drosophila. National Science Review, 2022. Xiupeng Chen, Jie Li, ..., He Tian, Yingchun Wang, Xun Huang, Yan Li, Sin Man Lam*, Guanghou Shui*.
PMID: 36713590
PMCID: PMC9875363
DOI: 10.1093/nsr/nwac148
Serine metabolism antagonizes antiviral innate immunity by preventing ATP6V0d2-mediated YAP lysosomal degradation. Cell Metabolism. 2021.Long Shen, Penghui Hu, ..., Zhe Liu, Ting Wang, Qiujing Yu*.
PMID: 33798471
DOI: 10.1016/j.cmet.2021.03.006